해결책
신경영상에는 실질적인 표준 문제가 있었다. 스캐너는 복잡한 파일을 생성했지만, 모든 연구실이 피험자, 세션, 과제 및 메타데이터를 서로 다르게 배치했다. 데이터를 공유하려면 분석을 실행하기 전에 맞춤형 정리가 필요했다.
BIDS는 파일 시스템 자체를 표준화하는 영리한 수를 두었다. 데이터셋은 subjects 및 sessions 같은 폴더, 미리 정의된 키-값 부분으로 구성된 파일명, 그리고 일반 도구로 편집할 수 있는 사이드카 JSON 또는 TSV 메타데이터가 되었다.
그 덕분에 채택이 누적되었다. 검증기는 누락된 메타데이터를 표시할 수 있었고, BIDS 앱은 하나의 입력 레이아웃을 가정할 수 있었으며, OpenNeuro 같은 저장소는 모든 연구실을 위한 데이터베이스 인터페이스를 새로 만들지 않고도 데이터셋을 수집할 수 있었다.
달성한 것
경로에 의미를 담다
신경영상에서 이미 흔히 쓰이던 파일 형식을 재사용했으며, 새로운 컨테이너로의 변환을 강제하지 않았다.
키-값 파일명 문법 덕분에 소프트웨어는 별도의 메타데이터 시스템을 열지 않고도 의미를 추론할 수 있었다.
검증기는 관례를 테스트 가능한 계약으로 바꾸었다.
확장 기능을 통해 커뮤니티는 원래 레이아웃을 깨뜨리지 않고 EEG, MEG, PET 및 기타 양식을 추가할 수 있었다.
연구 표준은 데이터가 사람들이 이미 사용하는 파일에 남아 있고 관례가 기계가 검증할 수 있을 만큼 엄격할 때 더 빨리 퍼진다.
그 후
BIDS는 광범위한 신경영상 생태계의 조직화 계층이 되었다. 이 프로젝트는 40개 이상의 기술 사양, 100개 이상의 샘플 데이터 모델, 2,000개의 공개 데이터셋, 300명 이상의 기여자를 보고하며, 2016년 Scientific Data 논문은 표준 인용으로 남아 있다.
근거 확인하기
출처
- BIDS Impact BIDS · bids.neuroimaging.io
- The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments Scientific Data · nature.com ·